Izolácia RNA

Izolácia RNA – 1
Izolácia RNA – 2
Izolácia RNA – 3
Izolácia RNA – 4
Izolácia RNA – 5
Izolácia RNA – 6
Izolácia RNA – 7
Izolácia RNA – 8
Izolácia RNA – 9
Izolácia RNA – 10
Izolácia RNA – 11

Izolácia RNA vo virológii

Izolácia RNA vo virológii – 1
Izolácia RNA vo virológii – 2
Izolácia RNA vo virológii – 3
Izolácia RNA vo virológii – 4
Izolácia RNA vo virológii – 5
Izolácia RNA vo virológii – 6

Troubleshooting

Problém

Príčina

Riešenie

Nízky výťažok

Vzorka bola skladovaná nevhodným spôsobom

Materiál na izoláciu RNA nebol okamžite zmrazený v tekutom dusíku alebo uchovaný v RNA later-i

Nekompletná homogenizácia

Kompletná homogenizácia tkaniva/vzorky. Lýza buniek nemôže prebehnúť dostatočne, ak materiál nie je kompletne zhomogenizovaný

RNA degradácia

Tkanivá neboli ihneď spracované

Tkanivá a bunky treba spracovať okamžite

Vzorky tkaniva alebo buniek pred izoláciou RNA zmrazovať v tekutom dusíku

Použiť RNA later na skladovanie vzoriek

Nevhodné podmienky pri izolácii RNA

Všetky kroky extrakcie RNA treba vykonávať na ľade/vrátane centrifugácie (pri 4°C)

Kontaminácia Rnázami

Pridávať DEPC do vody, ktorá sa používa pri izolácii RNA a jej rozpúšťaní

“Rnase-free” materiál a roztoky

Používať čisté rukavice, čistý priestor, pipety vyhradené len na prácu s RNA a filtrované špičky

Izolovaná RNA bola uložená pri nevhodnej teplote

Vzorky RNA treba uchovávať pri maximálne -80°C

DNA komtaminácia

Nevhodné pH pri extrakcii fenolom

Treba skontrolovať pH roztokov. Počas extrakcii fenolom musí byť pH 4-6 (kyslé), inak DNA nesotáva v organickej fáze, ale dostáva sa do vodnej fázy spolu s RNA

Pri fenolovej extrakcii bola vodná fáza kontaminovaná interfázou alebo organickou fázou

Použiť Dnázy