Troubleshooting
Problém
Príčina
Riešenie
Fragmentácia DNA
Nadmerná homogenizácia/vortexovanie vzorky
Nevortexovať vzorky DNA, nepoužívať mechanické narušenie tkanív. Jemne homogenizovať pipetovaním
DNA kontaminovaná Dnázami
Používať rukavice pri izolácii DNA a pracovať čo najčistejšie (používať reagencie, ktoré boli otestované na prítomnosť Dnáz)
Nízky výťažok DNA
Tkanivo obsahuje oveľa nižšie hladiny NK ako sa očakávalo
Zvýšiť množstvo tkaniva/buniek, ktoré má byť homogenizované
Neúplná lýza buniek
Úplné rozsuspendovanie buniek, predĺžiť čas potrebný na lýzu buniek
Neúplná elúcia
Väčší elučný objem a dlhšia doba elúcie môže zvýšiť výťažok
Neúplná obnova vyzrážanej DNA
Po zrážaní a centrifugácií, môžu byť časti DNA prilepené na stene mikroskúmavky. Opatrne odoberať roztoky, aby sa DNA neodsala počas pipetovania
Nedostatočná čistota DNA po spektrofotometrickom meraní
Prítomnosť kontaminantov (fenol, proteíny,…)
Opakovať precipitáciu alebo prečistenie DNA
Zrazenina vo vzorke DNA
Veľké množstvo DNA, nedošlo k rozpusteniu
Pridať viac elučného roztoku
Kontaminácia biologického pôvodu
Vyhodiť vzorku a zopakovať izoláciu